不能扣工资，根据《女职工劳动保护规定》第6条规定，怀孕女职工在劳动时间内进行产前检查，所需时间计入劳动时间。就此，《〈女职工劳动保护规定〉问题解答》中就 产前检查曾进一步规定为，女职工产前检查应按出勤对待，不能按病假、事假、旷工处理；对在生产第一线的女职工，要相应地减少生产定额，以保证产前检查时间。