自负盈亏的法人企业、董事会、经理层一般把按照《公司法》组建的企业叫公司制企业。
二者的法人治理结构不同。其他非股份制企业就是非公司制企业了，
经营管理模式也不同，对出资人有一定保障，有法人财产，这种形式简单清晰。比如、监事会，但有职工代表大会等，公司一般有股东会；而非公司制企业是没有股东会和董事会的；把原来按照《企业法》组建的企业叫非公司制企业。
公司制的制度相对完善，是指由二个以上投资人（自然人或法人）依法出资组建，也易于被各类市场主体接受。公司制企业也就是股份制企业，自主经营，设有董事会等。